Untersuchungsdauer von Wurzeln

Die Tücken der Technik und was Wurzeln damit zu tun haben…

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Bei der Untersuchung von Wurzeln, die einen Schaden in der unterirdischen Infrastruktur angerichtet haben nehmen wir uns als Technik PCR zu Hilfe. Es handelt sich um eine Technik mit durchschnittlich bis zu 150 Einzelschritten. Wenn die Proben gut zu bearbeiten sind, kann es schnell gehen bis zum Ergebnis innerhalb weniger Tage. Da es sich hier um Umweltproben, meist aus dem Erdbodenn handelt muss das Labor oft noch Reinigungsschritte vorab durchführen.

Eine solche Wurzel befindet sich im Untergrund, im Boden, im Abfluss oder wächst sonst wo. Aus dieser Umgebung entnommen, bringt die Wurzel manchmal sehr unangenehme Stoffe mit ins Labor, die die Untersuchung wirklich erschwer können. Diese Stoffe können die Reaktion blockieren, verlangsamen oder verunmöglichen.

Zudem ist so eine Wurzel ja nicht alleine im Untergrund. Da gibt es noch sehr viele andere Organismen, die sich an die Wurzeln heften oder auf die die Wurzel einfach trifft. Es können Mykorrhizapilze mit im Spiel sein, Moose, Flechten oder andere Kleinstpartikel die beim Abbau in die Erde gelangen. All das kann die Arbeit dieses Enzyms zumindest verlangsamen und weil DNA so winzig-klein ist, dass man sie nicht mal mit dem Mikroskop sehen kann muss man eben gucken, dass man die DNA in bestimmten Zwischenschritten mit einem Farb-Tag anreichert, so dass man die DNA indirekt über dieses Farb-Tags erkennen kann, sonst wüsste man überhaupt nicht, ob die Arbeit bis an diesen Punkt überhaupt funktioniert hat.

Ist man dann bei diesem Zwischenschritt angekommen und erkennt keinen Farb-Tag so muss das Labor nochmal ein paar Schritte zurück und an ein paar Stellschrauben drehen. Aufgrund der jahrelangen Erfahrung, weis man woran man drehen muss und die Untersuchung geht weiter. Insofern kann es eben dauern. In der Regel so um die drei Wochen. In manchen Fällen dann eben auch ein bisschen mehr oder, wenns gut läuft, auch deutlich weniger.